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文献导读:918博天娱乐官网探索PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

来源:庄义羽 日期:2025-03-14

2019年11月,加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》期刊上发表了一项关于肠道病毒感染诱发儿童急性无力脊髓炎(AFM)的研究。该研究采用了PhIP-seq技术和病毒组抗原库,对42名确诊AFM的儿童和58名患有其他神经系统疾病的对照组儿童的脑脊液样本进行了检测,筛选出与AFM病因学相关的病毒特异性抗体。

文献导读:918博天娱乐官网探索PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

研究结果表明,肠道病毒抗体在AFM患者组中显著富集,并通过ELISA实验验证这一发现。这一结果提示,肠道病毒感染可能是该研究中大多数AFM病例的病因,为肠道病毒脑脊液抗体测定方法的快速开发提供了方向,有助于未来对肠道病毒相关的AFM进行更有效的临床诊断。

AFM于2012年首次在美国被发现,之后有超过500名儿童被确诊。在每两年一次的流行周期内,肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的暴发时常伴随AFM病例的增加。然而,由于劣于50%的病人样本(如鼻咽或口咽拭子)中能够检测到肠道病毒,仅有约2%的AFM儿童脑脊液中可检测到肠道病毒核酸,因此AFM的病因一直难以确认。研究人员担忧AFM可能由尚未识别的病原体或副感染的免疫反应引发。

为了明确AFM的发病机制,研究者利用PhIP-seq技术解析了AFM患儿及对照样本的脑脊液中病毒抗体谱。该技术能够高通量地一次性检测数百种病毒的特异性抗体,最终使用ELISA实验对结果进行了验证。

研究的主要结果包括:

结果一:通过PhIP-seq技术分析AFM组儿童的病毒抗体响应,发现小RNA病毒(Picornaviridae科)的肠病毒(Enterovirus属)抗体在AFM组中显著高于对照组。

结果二:数据分析揭示,免疫原性抗原肽段来自于整个肠道病毒基因组的蛋白质。序列分析显示,PhIP-seq技术不仅能识别已知的线性表位,还能发现新的线性结合表位。

结果三:用EV病毒VP1蛋白进行ELISA验证,结果证实在AFM组大多数脑脊液样本中可以检测到EV信号,这与PhIP-seq的检测结果高度一致。

PhIP-seq技术是一种高通量抗体谱检测技术,结合了大规模噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术,能够针对数十万种抗原进行血清检测,是免疫相关研究的重要工具。

上海抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”)专注于蛋白组和抗体组研究,积累了超过20年的经验。公司致力于抗体组学前沿技术的持续开发,建立了PhIP-seq技术平台,定制了多种抗原组库,并提供定制化抗原建库服务,开展PhIP-seq平台的高通量筛选和数据分析技术服务,为抗体组学研究提供全面解决方案。

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