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NEWS单细胞分析常见问答 - 918博天娱乐官网解答
来源:晏柔进 日期:2025-03-11918博天娱乐官网生命科学单细胞测序(10×genomics技术)的原理是什么?
10xGenomics技术是一种创新的生命科学单细胞测序方法,能够以单细胞的分辨率获取基因组、转录组和表观组数据。其原理主要包括以下几个关键步骤:
1. 单细胞悬浮液制备:初步将组织或细胞样本转化为单细胞悬浮液,通常通过机械或酶处理完成。
2. 微滴封装:将单细胞悬浮液与特制的凝胶珠混合,这些凝胶珠带有独特的分子标签(条形码)。结合微流体技术,单个细胞和凝胶珠被封装到微滴中,理想情况下每个微滴仅含一个细胞和一个凝胶珠。
3. mRNA捕获和条形码标记:微滴中细胞破裂,释放mRNA。mRNA分子与凝胶珠上的寡核苷酸探针结合,探针上有聚A尾,从而使得mRNA的3'末端(带有poly-A尾的端)有效结合。这种结合使得mRNA与细胞特异性条形码和UMI(独特分子标识符)一同被捕获,UMI有助于消除PCR扩增中的偏差,从而更精确地估算原始mRNA的数量。
4. 逆转录和扩增:捕获的mRNA被逆转录成cDNA,并在微滴中进行PCR扩增,此过程保留并扩增细胞特异性条形码和UMI到每个cDNA分子上。
5. cDNA文库制备:扩增后,cDNA从微滴中收集,建立测序文库。这一文库包含了带有细胞特异性条形码和UMI的cDNA分子。
6. 高通量测序:利用高通量测序平台(如Illumina)对cDNA文库进行测序,所获得的数据可用于分析基因表达水平、异质性及细胞亚群的鉴定等。
7. 数据分析:处理和分析测序数据,将读取(reads)分配给不同的细胞,并根据UMI计算基因表达量。此外,这些数据还可以用于进一步的生物信息学分析,比如聚类细胞、搜索差异表达基因及细胞间相互作用研究等。
918博天娱乐官网如何看待单细胞测序及转录组测序的可重复性和指导意义?
单细胞测序和转录组测序在生物医疗研究中发挥着至关重要的作用,它们为我们提供了深入了解细胞和组织的宝贵信息。然而,在评估这些技术的可重复性和实际指导意义时,需关注几个方面:
1. 可重复性:确保单细胞测序和转录组测序结果可重复,需要提升技术成熟度并严格遵循实验操作。实验设计、样品制备、测序平台及数据处理流程的每一个环节均可能影响结果的可重复性。因此,研究人员需对各实验流程加强关注,并进行严格的质量控制。
2. 生物学背景:为发挥单细胞测序和转录组测序的最大效用,研究者需充分理解所研究的生物系统及问题背景。这些技术提供的信息涉及基因表达与调控,研究人员应具备相关领域知识以解读数据并得出结论。
3. 数据解析与解释:数据分析和解释是单细胞测序和转录组测序的关键环节,选择合适的分析方法并正确解读结果,对实验结果的指导意义至关重要。为确保分析的可靠性,研究人员应使用已验证的分析工具和流程,且需根据具体研究问题调整参数。
4. 整合其他数据类型:单细胞测序和转录组测序提供基因表达的信息,但常常需结合其他数据类型(如基因组、表观组和蛋白质组数据)以更全面地理解生物过程。通多样数据整合,研究人员能够更好地了解基因调控及功能,从而提升研究成果的指导意义。
综上所述,单细胞测序和转录组测序在生物医疗研究中具显著指导意义。为确保技术可靠性与实际指导效果,研究者需关注实验设计、数据处理及生物学背景等多个方面。通过严谨的实验操作与合理的数据解析,这些技术能为我们提供关于生物系统的宝贵见解。
918博天娱乐官网单细胞质谱流式技术分析:体积和尺寸如何测量,原理是什么?
单细胞质谱流式技术(Single-cell mass cytometry,简称CyTOF)融合了流式细胞术与质谱,主要用于分析细胞表面及细胞内的分子。流式细胞术能够实现细胞体积与尺寸的测量,其基本原理如下:
1. 前向散射(Forward Scatter,FSC):FSC与细胞大小相关。当激光束照射细胞时,细胞会将一部分光向前散射。较大的细胞散射的光线较多,因此FSC常用于估计细胞的大小。
2. 侧向散射(Side Scatter,SSC):SSC与细胞的复杂性或颗粒度相关。激光照射细胞后,细胞内的粒子会导致光线向侧面散射,SSC可用来估算细胞的颗粒度或内部结构的复杂性。
3. 染料测量:某些流式细胞术通过染料来测量细胞体积,这些染料能选择性地与细胞质结合,而结合的染料量与细胞体积成正比。通过测量荧光强度,可以推算出细胞的体积。
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